运管有权扣驾驶证，但无权扣行驶证。

关于驾驶证的扣留，根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》的规定，对道路交通安全违法行为人处以罚款或者暂扣驾驶证处罚的，由违法行为发生地的县级以上人民政府公安机关交通管理部门或者相当于同级的公安机关交通管理部门作出决定。

而行驶证是准予机动车在我国境内道路上行驶的法定证件，由车辆管理机关发放，运管部门并非行驶证的管理和发放机构，因此运管无权扣留行驶证。