不同地区支付宝缴纳摩托车违章罚款的操作可能会有所差异，一般流程如下：

1. 打开支付宝应用;

2. 在支付宝首页找到“更多”选项，点击进入;

3. 在新的界面中找到“城市服务”(若首页有“市民中心”，也可点击进入找到“交管”图标);

4. 进入城市服务后，定位所在城市，找到“交通违法处理”或“车辆违章查询、交纳罚款”等相关功能，点击进入;

5. 按照提示输入车牌号、发动机号后六位等车辆信息，进行查询;

6. 系统会显示车辆的违章信息，点击对应的“违法记录”进入缴费页面;

7. 确认违章信息无误后，点击“确认缴费”;

8. 选择支付方式并完成付款。

部分地区可能还支持通过支付宝搜索“交管12123”小程序，进行违章查询和缴纳罚款的操作。

需要注意的是，支付宝缴纳违章罚款可能存在一定的限制，例如只能处理部分地区或特定类型的违章，且可能不涉及扣分的情况。如果涉及扣分，可能仍需到当地车管所或交警大队进行处理。

另外，在缴纳罚款前，需确保所提供的车辆信息准确无误。同时，要及时关注当地的交通法规和相关政策变化，以确保能够顺利完成违章罚款的缴纳。如果在操作过程中遇到问题，建议联系当地的交警部门或支付宝客服寻求帮助。